INTRODUCCIÓN: La malaria cerebral es una de las complicaciones más importantes de la infección con Plasmodium falciparum. Ante el reto de la elucidación de su fisiopatología, los modelos murinos han sido de gran utilidad. Sin embargo, se presentan hallazgos contradictorios asociados con la histopatología del modelo murino de C57Bl/6 infectados con Plasmodium berghei Anka debido a la utilización de diferentes protocolos y sublíneas de ratones. OBJETIVOS: Caracterizar la presentación clínica de la malaria cerebral en el modelo C57Bl/6-P. berghei ANKA y describir las afectaciones histopatológicas en tejidos encefálicos. MATERIALES Y MÉTODOS: Se seleccionaron 6 ratones hembras C57BL/6 (CENPALAB)  infectadas con  P. berghei ANKA en estado terminal, se les aplicó punto final humanitario y rápidamente se extrajeron los encéfalos que se conservaron en formalina al 10% en buffer fosfato salino, se embebieron en parafina, se seccionaron en cortes coronales de 5 micras y se colorearon con hematoxilina-eosina. Estos cortes se compararon con los correspondientes a 4 controles sanos procesados con la misma metodología. RESULTADOS: Los principales signos clínicos observados en los animales parasitados fueron encorvamiento, desplazamiento con inestabilidad, movimiento limitado, parálisis parcial, dificultad respiratoria, posición de lado o plana, convulsiones y coma. El método de colecta de los encéfalos resultó adecuado para el análisis de los grupos de estudio. Solamente se presentaron afectaciones en los tejidos encefálicos de los animales con signos neurológicos. Se presentaron daños hemorrágicos y otros tipos de afectaciones tisulares. CONCLUSIONES: Las descripciones histopatológicas confirmaron la presencia de daño encefálico en esta infección experimental lo cual fundamenta un acercamiento a la malaria cerebral humana.